63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4615 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4615  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.82 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.21 
 
 
136 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5532  hypothetical protein  52.68 
 
 
130 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353133  normal  0.762952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  42.02 
 
 
142 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0166  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.36 
 
 
134 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  39.5 
 
 
141 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2388  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.86 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0476612  normal  0.436091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3305  hypothetical protein  45.24 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0254  hypothetical protein  47.41 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0189  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.27 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.574477  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7081  hypothetical protein  45 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  48.82 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0837  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.14 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.4 
 
 
132 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  42.98 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  42.28 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.61 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000699293  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11910  hypothetical protein  40.5 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  40.62 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  38.66 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0871  hypothetical protein  41.53 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.325277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  36.67 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  37.07 
 
 
237 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25510  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  35.83 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0692  hypothetical protein  40.68 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1536  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.02 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354467  normal  0.0455127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.08 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.3 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.08 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.08 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20850  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  36.09 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  34.88 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0009  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.03 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25140  hypothetical protein  38.14 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3298  hypothetical protein  37.68 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.908774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  34.19 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  36.44 
 
 
261 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  31.54 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.61 
 
 
244 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.193338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  35.25 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  35.83 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  33.87 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  27.35 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  29.37 
 
 
116 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  30.65 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  44.9 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.3 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  27.91 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  33.85 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  28.79 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  28.69 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  30.65 
 
 
119 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>