73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0871 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0871  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.325277  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.72 
 
 
132 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0692  hypothetical protein  56.56 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2388  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.54 
 
 
118 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0476612  normal  0.436091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7081  hypothetical protein  50.41 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  51.72 
 
 
129 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.79 
 
 
244 aa  103  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.193338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0837  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.14 
 
 
122 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  48.21 
 
 
237 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  49.58 
 
 
136 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  46.61 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  49.14 
 
 
261 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  40.71 
 
 
123 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  45.13 
 
 
161 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  43.64 
 
 
125 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25510  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  44.44 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11910  hypothetical protein  43.33 
 
 
143 aa  87  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25140  hypothetical protein  45.69 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.09 
 
 
140 aa  84.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000699293  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0254  hypothetical protein  42.37 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.83 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  39.82 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5532  hypothetical protein  42.02 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353133  normal  0.762952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0009  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.19 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  42.74 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.88 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.74 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  36.07 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20850  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  39.06 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  35.25 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3298  hypothetical protein  40.46 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.908774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  37.39 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4615  hypothetical protein  41.53 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.82 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.79 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.79 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.79 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3305  hypothetical protein  35.38 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  32.81 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0189  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.574477  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  31.97 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  31.25 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  32.26 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  34.92 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  31.4 
 
 
119 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  32.03 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0166  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.3 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0331  hypothetical protein  30.08 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  31.45 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1536  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354467  normal  0.0455127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  31.36 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  28.81 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  34.13 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  28.81 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  32.46 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  32.5 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  30.43 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  30.25 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  28.81 
 
 
116 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.35 
 
 
136 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  31.15 
 
 
241 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  27.27 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  34.69 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  29.92 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>