91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3180 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  296  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  91.43 
 
 
142 aa  275  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.33 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2388  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.5 
 
 
118 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0476612  normal  0.436091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4615  hypothetical protein  39.5 
 
 
127 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5532  hypothetical protein  44.07 
 
 
130 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353133  normal  0.762952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.38 
 
 
136 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0254  hypothetical protein  44.63 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  41.94 
 
 
138 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7081  hypothetical protein  41.8 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  32.82 
 
 
125 aa  90.5  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  40.8 
 
 
161 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3305  hypothetical protein  35.56 
 
 
134 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  39.84 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0189  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.04 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.574477  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0166  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 
134 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1536  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.96 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354467  normal  0.0455127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  35.94 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  36.29 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0692  hypothetical protein  37.19 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0837  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  35.51 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0871  hypothetical protein  36.07 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.325277  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25510  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  32.8 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  33.61 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  34.59 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  35.71 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 
129 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 
129 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 
129 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11910  hypothetical protein  35.54 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  29.75 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
244 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.193338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  31.2 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  29.13 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  25.95 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25140  hypothetical protein  29.92 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  31.3 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  27.56 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  30.65 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000699293  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  27.56 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  27.78 
 
 
127 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  25 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  28.12 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20850  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  29.92 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  26.83 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.44 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  24.83 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 
118 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  25.81 
 
 
124 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.22 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  24.59 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0009  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  26.98 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  27.54 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  26.17 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  24.6 
 
 
228 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  27.56 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  27.27 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.83 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  24.22 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  24.22 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  24.22 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.31 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  29.61 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.4 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.81 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.26 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  24.81 
 
 
132 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  26.92 
 
 
121 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  24.46 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  25.81 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  23.81 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  24.82 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  27.5 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  26.36 
 
 
125 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>