126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3966 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  94.85 
 
 		 136 aa  267  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.14 
 
 		 395 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  35.45 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  39.82 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  39.5 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  39.09 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  41.03 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.78 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  37.39 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  35.34 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.46 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  37.29 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  37.1 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.29 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  32.89 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  32.73 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  32.19 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.64 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  32.74 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  37.07 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  33.64 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  37.72 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  36.21 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  30.88 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  32.73 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  37.39 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 		 335 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.13 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  28.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  29.93 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  35.43 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  35.04 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  34.23 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  36.59 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  28.33 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.51 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.88 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  28.26 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  35.09 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  34.55 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  30.15 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  33.91 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  36.13 
 
 		 253 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  31.4 
 
 		 228 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  28.78 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  30.37 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  30.58 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  31.93 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  34.71 
 
 		 127 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  30.17 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  30.07 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  29.86 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  33.61 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.43 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  35.04 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  31.62 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  34.86 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  34.17 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  32.5 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  27.97 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  31.03 
 
 		 239 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  33.61 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  27.74 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  29.17 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>