98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5162 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  47.33 
 
 
151 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  42.36 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  47.62 
 
 
145 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  41.67 
 
 
144 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  42.28 
 
 
144 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  43.24 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  44.22 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  38.93 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  41.18 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  38.36 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  38.67 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  34.03 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  36.31 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  38.19 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  35.57 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  36.48 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  34.9 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  31.94 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  32.05 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  37.75 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  35.8 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  34.57 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  34.23 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  37.58 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  35.8 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  33.12 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  33.95 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  34.21 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  34.78 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  38.85 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  32.08 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  31.97 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.51 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  34.93 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  30.56 
 
 
127 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  31.43 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  26.54 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  33.77 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  29.73 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.46 
 
 
124 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.77 
 
 
121 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
335 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  31.29 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  30.86 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  26.76 
 
 
231 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.88 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.47 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.47 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.47 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  31.29 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  47.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  32.14 
 
 
234 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  34.04 
 
 
253 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  29.29 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  27.97 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  32.24 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.38 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.41 
 
 
113 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.41 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  29.93 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1502  hypothetical protein  32.97 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.364685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.72 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  29.86 
 
 
240 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  37.41 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  31.94 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  30.95 
 
 
217 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  27.7 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  28.19 
 
 
130 aa  43.9  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  34.51 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  32.85 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  32.08 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  36.69 
 
 
239 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  28.57 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  30.71 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  27.86 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  33.8 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  33.8 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  28.99 
 
 
449 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  29.66 
 
 
113 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  30.59 
 
 
236 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  30.07 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  31.21 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  27.89 
 
 
115 aa  40.8  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  33.09 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>