85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5883 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  470  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  59.73 
 
 
236 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.44 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  44.6 
 
 
225 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.3 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  40 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  45.88 
 
 
218 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.57 
 
 
235 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.81 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  33.91 
 
 
449 aa  111  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.34 
 
 
224 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  48.7 
 
 
417 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  35.92 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  38.66 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  36.03 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.97 
 
 
211 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  33.48 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  31.69 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  34.19 
 
 
116 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  34.19 
 
 
116 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  34.45 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  34.19 
 
 
116 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.11 
 
 
121 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  35.16 
 
 
124 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  34.13 
 
 
124 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.38 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  33.93 
 
 
116 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  32.46 
 
 
115 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  36.36 
 
 
141 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
136 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  39.71 
 
 
121 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  32.23 
 
 
127 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  31.91 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  32.74 
 
 
116 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  29.82 
 
 
113 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.95 
 
 
395 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  33.96 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 
113 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
113 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 
118 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
335 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  33.93 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  30.77 
 
 
119 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  28.46 
 
 
129 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  28.68 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  25.81 
 
 
127 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.46 
 
 
136 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  30.47 
 
 
127 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  27.74 
 
 
142 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  32.93 
 
 
146 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  35.38 
 
 
127 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  34.21 
 
 
141 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  28.46 
 
 
128 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  28.21 
 
 
128 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  34 
 
 
132 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  36.76 
 
 
144 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 
126 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  28.17 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  30.97 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  33.04 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  27.15 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  30.4 
 
 
127 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  29.91 
 
 
119 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  29.41 
 
 
125 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  38.03 
 
 
117 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  40.3 
 
 
114 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  25.55 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  26.95 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  30.88 
 
 
142 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  33.04 
 
 
125 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  24.11 
 
 
144 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  30.7 
 
 
136 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.62 
 
 
129 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  24.09 
 
 
150 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.5 
 
 
126 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  32.41 
 
 
117 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
115 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
115 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
115 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>