76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0947 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  59.73 
 
 
235 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.7 
 
 
218 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  45.33 
 
 
225 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.78 
 
 
231 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  46.43 
 
 
218 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  42.54 
 
 
217 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  36.7 
 
 
449 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.17 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  35.14 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.25 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.74 
 
 
232 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  34.65 
 
 
236 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.21 
 
 
224 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  35.78 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  35.78 
 
 
417 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.28 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.93 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.1 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.56 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
121 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  28.67 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  27.42 
 
 
127 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  30.15 
 
 
144 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  36.61 
 
 
116 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  36.61 
 
 
116 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  34.62 
 
 
124 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  36.61 
 
 
116 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  52.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  34.82 
 
 
127 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  30.87 
 
 
153 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  32.74 
 
 
120 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  30.34 
 
 
146 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
335 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  35.96 
 
 
134 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  29.31 
 
 
128 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  29.46 
 
 
129 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  28.35 
 
 
128 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  32.41 
 
 
119 aa  48.9  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
136 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  28.28 
 
 
150 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  28.86 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  29.6 
 
 
124 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  31.19 
 
 
125 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
136 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  23.36 
 
 
144 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  31.43 
 
 
145 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  33.93 
 
 
114 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  28.93 
 
 
143 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  34.68 
 
 
144 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  27.54 
 
 
141 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  27.74 
 
 
144 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  35.19 
 
 
116 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.74 
 
 
395 aa  46.2  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  26.28 
 
 
144 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  31.78 
 
 
113 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  34.19 
 
 
241 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  32.11 
 
 
136 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  30.3 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  28.19 
 
 
153 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  30.77 
 
 
117 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  31.48 
 
 
119 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5532  hypothetical protein  33.08 
 
 
130 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353133  normal  0.762952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  29.2 
 
 
144 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  28.23 
 
 
127 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  25.44 
 
 
127 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  27.86 
 
 
149 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  31.36 
 
 
131 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  30.23 
 
 
147 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  29.36 
 
 
125 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>