26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3968 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  418  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  72.9 
 
 		 223 aa  315  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  71.5 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  39.72 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  42.92 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.38 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.38 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  40.58 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.29 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  38.14 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.5 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  35.78 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  34.09 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.75 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.77 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  31.63 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  29.25 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  26.76 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.43 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 		 125 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  35.05 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  35.05 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  35.05 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  27.84 
 
 		 119 aa  42.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  25 
 
 		 127 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>