24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3546 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  78.44 
 
 		 223 aa  347  7e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  71.5 
 
 		 215 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  40.85 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.68 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  39.71 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.5 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.64 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  36.27 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.91 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  33.02 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  36.03 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  31.28 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  36.57 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.51 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.38 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.84 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  32.09 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  28.95 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.06 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  26.61 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  28.35 
 
 		 129 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  31 
 
 		 119 aa  45.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  35.42 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>