29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0396 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  443  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  78.44 
 
 		 236 aa  347  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  72.9 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.32 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  40.64 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  38.07 
 
 		 449 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.21 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.24 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  42.66 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  34.43 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.17 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  38.66 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  35.14 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  31.43 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.96 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.31 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  32 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.54 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  28.97 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.09 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  28.23 
 
 		 127 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  29.13 
 
 		 129 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  30.3 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  28.35 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  30.21 
 
 		 130 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  26.76 
 
 		 144 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  34.38 
 
 		 116 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  34.38 
 
 		 116 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  34.38 
 
 		 116 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>