216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3393 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  100 
 
 
224 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  53.05 
 
 
219 aa  201  8e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  46.34 
 
 
225 aa  188  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  49.53 
 
 
231 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.89 
 
 
218 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  47.35 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.52 
 
 
235 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  49.25 
 
 
217 aa  164  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  49.3 
 
 
211 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.56 
 
 
256 aa  134  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.01 
 
 
224 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  35.71 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  37.86 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  35.34 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22650  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  57.84 
 
 
103 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1724  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  54.9 
 
 
103 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  36.23 
 
 
449 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  34.48 
 
 
223 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  42.94 
 
 
236 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  35.75 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  58.33 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.48 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.8 
 
 
93 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0727  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.11 
 
 
101 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.856744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.1 
 
 
119 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5415  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.67 
 
 
107 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.301149  normal  0.236997 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1412  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.06 
 
 
104 aa  62.4  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0351237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.57 
 
 
97 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.36 
 
 
101 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11183  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  35.53 
 
 
94 aa  60.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  34.23 
 
 
417 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  50 
 
 
92 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.44 
 
 
92 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35 
 
 
120 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35 
 
 
131 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31220  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.37 
 
 
96 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12116  normal  0.529511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1266  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.76 
 
 
109 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.421777  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6480  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.38 
 
 
128 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.28 
 
 
94 aa  58.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5747  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.71 
 
 
125 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674967  hitchhiker  0.0082739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.11 
 
 
91 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2406  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 
127 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0180  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.84 
 
 
133 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3578  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32 
 
 
125 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4534  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.16 
 
 
126 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221765  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2141  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.62 
 
 
125 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.206758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0099  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  42.86 
 
 
101 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1757  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.62 
 
 
125 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1805  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.62 
 
 
125 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.696832  normal  0.809401 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1468  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.5 
 
 
91 aa  56.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3550  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.62 
 
 
101 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0874  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.97 
 
 
124 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000104315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.79 
 
 
100 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2778  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32 
 
 
125 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.196834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2978  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.72 
 
 
125 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36 
 
 
96 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.46 
 
 
97 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5972  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.44 
 
 
125 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0257704  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3226  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.68 
 
 
99 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07131  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.06 
 
 
96 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0700  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 
96 aa  55.1  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000704537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1646  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.7 
 
 
124 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000199305  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0169  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.93 
 
 
103 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40 
 
 
102 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3534  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.71 
 
 
125 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.53 
 
 
149 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.31 
 
 
93 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0095  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.46 
 
 
102 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0673  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.06 
 
 
96 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252201  normal  0.29801 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1636  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.93 
 
 
135 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.113224  normal  0.269211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2524  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.3 
 
 
101 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1232  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.87 
 
 
93 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187262  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0068  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40 
 
 
102 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586364  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.72 
 
 
102 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0458718  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1862  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.71 
 
 
99 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.731074  normal  0.634573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.31 
 
 
93 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0423  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.33 
 
 
102 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0873701  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3384  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.66 
 
 
130 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1617  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.66 
 
 
130 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4076  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.66 
 
 
130 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0896385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2985  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.66 
 
 
130 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3071  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.1 
 
 
105 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2926  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.35 
 
 
101 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0207  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39.66 
 
 
123 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0703  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.24 
 
 
101 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0706  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.38 
 
 
102 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05551  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.88 
 
 
96 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.593929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4002  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.35 
 
 
101 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0006  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.82 
 
 
97 aa  51.6  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3347  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.23 
 
 
98 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0057  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.27 
 
 
93 aa  51.6  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.80763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.32 
 
 
94 aa  51.6  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0497  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.43 
 
 
114 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.18 
 
 
99 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0077  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.68 
 
 
102 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.1 
 
 
105 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4051  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.5 
 
 
101 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4044  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.38 
 
 
94 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2045  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.33 
 
 
107 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0827962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>