118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4247 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  258  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  74.42 
 
 
129 aa  192  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  70.31 
 
 
128 aa  184  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  64.58 
 
 
144 aa  183  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  65.28 
 
 
144 aa  179  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  62.5 
 
 
144 aa  176  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  61.11 
 
 
144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  58.33 
 
 
144 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  51.03 
 
 
145 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  48.65 
 
 
153 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  46.9 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  47.55 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  47.02 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  44.37 
 
 
153 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1502  hypothetical protein  70.67 
 
 
124 aa  104  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.364685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  38.36 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  38.51 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  37.58 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  43.7 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  37.68 
 
 
142 aa  76.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  40.58 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  36.96 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  34.9 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  42.19 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  39.37 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  34.75 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  37.32 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  39.13 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  39.13 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  36.49 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  34.44 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.8 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  39.42 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  39.52 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  40.65 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  34.84 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  51.9 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  41.98 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  39.52 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  36.49 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.54 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  34.45 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  35 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  36.67 
 
 
245 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  36.51 
 
 
234 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.43 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  39.83 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  40.16 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  38.14 
 
 
228 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  33.9 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  33.12 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  38.52 
 
 
335 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  40.5 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  32.24 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  36.29 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  45.78 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  35.29 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  39.17 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  37.78 
 
 
124 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  32.85 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  39.17 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 
113 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  36.44 
 
 
239 aa  57.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  32.8 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  31.71 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  38.21 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  31.71 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.19 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.82 
 
 
113 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.54 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  36.07 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  34.31 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.58 
 
 
218 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  36.75 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  32.26 
 
 
225 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  37.96 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  34.56 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  31.45 
 
 
218 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  30.65 
 
 
241 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  36.44 
 
 
245 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.86 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  34.68 
 
 
253 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  29.61 
 
 
146 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  34.85 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  36.19 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  28.23 
 
 
223 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  30.16 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  34.71 
 
 
136 aa  48.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  26.61 
 
 
236 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>