39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1502 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1502  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.364685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  67.33 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  74.67 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  72 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  74.67 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  72 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  70.67 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  60 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  56.58 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  57.89 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  53.95 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  53.95 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  53.95 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  51.32 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  44 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  40.79 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  35.35 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  45.71 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  32.97 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  33.63 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  40.58 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  44.29 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  41.43 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  40.28 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  42.47 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  36.13 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  37.14 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  38.57 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  37.62 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  38.57 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  41.1 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>