123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2066 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  309  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  81.05 
 
 
153 aa  257  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  80.39 
 
 
153 aa  256  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  65.33 
 
 
145 aa  185  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  61.69 
 
 
145 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  56.67 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  57.05 
 
 
144 aa  154  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  56.38 
 
 
144 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  53.38 
 
 
144 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  56.38 
 
 
144 aa  141  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  54.05 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  52.7 
 
 
128 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  48.99 
 
 
144 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  49.36 
 
 
146 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  48.65 
 
 
127 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  41.88 
 
 
151 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  42.11 
 
 
142 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  43.51 
 
 
145 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  37.25 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  39.87 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  40.41 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  35.98 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  36.88 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1502  hypothetical protein  57.89 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.364685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  38.04 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  36.31 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  38.1 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  36.73 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  38.04 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  36.99 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  38.1 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  35.53 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  35.4 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  36.84 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  36.31 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  32.65 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  33.56 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  33.56 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  37.18 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  33.56 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  38.78 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  36.99 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  34.91 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  34.25 
 
 
116 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  36.53 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.77 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  48.1 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  35.15 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  32.03 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  36.91 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  32.7 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  47.44 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  36.14 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  52.11 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
335 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.94 
 
 
115 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  28.31 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.94 
 
 
115 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.39 
 
 
113 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.94 
 
 
115 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  30.82 
 
 
245 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  32.88 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  32.47 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  35.04 
 
 
239 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.88 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  43.04 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  32.34 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  32.68 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  31.54 
 
 
253 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.51 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  33.1 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  33.56 
 
 
127 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  34.25 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  33.56 
 
 
234 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 
136 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.08 
 
 
218 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  31.51 
 
 
245 aa  51.2  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  43.04 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  30.2 
 
 
241 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  35.71 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.05 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  33.96 
 
 
235 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  31.93 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.48 
 
 
231 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  29.73 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  39.58 
 
 
240 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  31.58 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3567  hypothetical protein  43.42 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.41 
 
 
219 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3562  hypothetical protein  43.42 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00833026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3635  hypothetical protein  43.42 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276283  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  39.02 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  38.1 
 
 
225 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05900  hypothetical protein  44 
 
 
63 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.02 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  36.59 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>