140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4667 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  271  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  53.91 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  48.12 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  44.96 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.7 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  48.12 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  44.7 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.31 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.8 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  47.29 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  46.46 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  46.46 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  40.77 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  48.06 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  45.67 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  44.88 
 
 		 228 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.15 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  40.44 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  44.36 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  40.16 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  41.04 
 
 		 245 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  37.01 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  44.53 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  45.11 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  40.6 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  41.35 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  40.69 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  41.04 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  42.14 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  40.16 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  38.58 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  39.13 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  40.74 
 
 		 335 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  41.61 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  40.15 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  41.98 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  40.16 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  41.22 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  39.46 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  43.36 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  37.78 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  42.75 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  42.36 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  41.01 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  37.69 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.76 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  39.39 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  38.73 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  38.13 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  42.96 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  39.53 
 
 		 253 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  37.58 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  36.81 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  36.55 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  36.81 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.76 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  31.43 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  36.18 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  41.09 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  41.27 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  37.93 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  35.83 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  36.44 
 
 		 240 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  35.66 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  40.31 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  39.06 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  33.58 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  35.43 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  38.52 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  34.68 
 
 		 234 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.88 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  34.38 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  37.84 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  34.56 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  32.56 
 
 		 241 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.79 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  31.2 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  29.46 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.11 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  31.78 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>