115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3103 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1814  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.01 
 
 		 172 aa  183  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  40.18 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  40.18 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  37.84 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  40.18 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.21 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  36.61 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  37.74 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.9 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  35.54 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.45 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.04 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  36.04 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  41.74 
 
 		 245 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  37.72 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  32 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  31.03 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  37.19 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  39.13 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  36.61 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  35.4 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  34.68 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  29.71 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  31.76 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  26.67 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  31.9 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  34.13 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  32.17 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  32.17 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.23 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  31.9 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  32.77 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  31.37 
 
 		 240 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  29.92 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  29.86 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  26.72 
 
 		 241 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  26.39 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  32.17 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  30.43 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  39.58 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  37.72 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  27.33 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  38 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  32.23 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  32.5 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  32.77 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  27.69 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  32.23 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  31.97 
 
 		 234 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  33.58 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  32.61 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  29.71 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.19 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.36 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  26.9 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  33.96 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  29.5 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  35.65 
 
 		 245 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  26.95 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  32 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.09 
 
 		 395 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.94 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  30.7 
 
 		 449 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.82 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  30.71 
 
 		 236 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  31.71 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  28.45 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>