100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5109 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.45 
 
 
123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2917  hypothetical protein  51.3 
 
 
118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.037261  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.28 
 
 
119 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.98 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  36.97 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.61 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  34.43 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  33.93 
 
 
240 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  33.64 
 
 
239 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  37.82 
 
 
130 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  38.05 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  33.04 
 
 
118 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  34.21 
 
 
241 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  36.44 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  35.09 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.44 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  37.72 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  30.08 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
335 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  41.67 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  41.67 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  38.83 
 
 
117 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  33.04 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  34.78 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  39.58 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  35.29 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  33.93 
 
 
245 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.18 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  35.65 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  38.26 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  35.59 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  51.85 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  30.83 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  39.29 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  36.7 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.74 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  35.16 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.74 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.74 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.96 
 
 
217 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.91 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.26 
 
 
395 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  33.96 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.58 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  43.66 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  34.88 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  32.23 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  33.06 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  48.21 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  31.62 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  33.68 
 
 
230 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  29.14 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  29.27 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  31.36 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  33.93 
 
 
228 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  33.91 
 
 
253 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  31.58 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  43.86 
 
 
135 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  33.59 
 
 
124 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  31.29 
 
 
153 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.74 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.05 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.21 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.63 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  33.04 
 
 
245 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  34.06 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  32.71 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  30.56 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7081  hypothetical protein  28.33 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  35.87 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  33.96 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  33.94 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  28.44 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  34.58 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  32.71 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  31.25 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  44.44 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  37.61 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  34.15 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.21 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  43.86 
 
 
134 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  41.51 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  29.77 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  32.73 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
238 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  30.3 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  29.79 
 
 
145 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>