58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1852 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  72.44 
 
 		 127 aa  197  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  53.23 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  50.78 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  51.56 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  51.56 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.62 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  43.7 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6183  hypothetical protein  34.62 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  37.01 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2666  hypothetical protein  35.61 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  39.51 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6209  hypothetical protein  29.2 
 
 		 244 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  31.07 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0165  hypothetical protein  49.06 
 
 		 253 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.78 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  45.28 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  31.19 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  32.35 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  36.84 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  38.96 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.17 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  25.96 
 
 		 249 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  30.51 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  30.97 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  29.36 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  28.72 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  35 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  29.06 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  29.17 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  33.64 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1250  hypothetical protein  26.61 
 
 		 243 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  30.28 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.68 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  30.91 
 
 		 245 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  43.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1249  hypothetical protein  24.32 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  30.3 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  28.07 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0962  hypothetical protein  30.19 
 
 		 248 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  29.37 
 
 		 124 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>