39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0962 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0962  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  500  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  52.44 
 
 
249 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1281  hypothetical protein  50.41 
 
 
245 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150558  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0165  hypothetical protein  44.09 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6209  hypothetical protein  37.7 
 
 
244 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1249  hypothetical protein  32.51 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106089  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1250  hypothetical protein  31.4 
 
 
243 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114148  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  37.84 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  28.4 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  35.4 
 
 
123 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  28.23 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 
125 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  35.48 
 
 
125 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  57.45 
 
 
117 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  32.26 
 
 
127 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  48.89 
 
 
124 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  33.04 
 
 
113 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.35 
 
 
113 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
111 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.22 
 
 
118 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  31.82 
 
 
116 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  30.11 
 
 
128 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  34.44 
 
 
130 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  28.83 
 
 
116 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.37 
 
 
118 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 
113 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  29.82 
 
 
125 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 
115 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 
115 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 
115 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  35.48 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  44.19 
 
 
124 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  29.82 
 
 
125 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  32.81 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  29.82 
 
 
125 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  30.58 
 
 
132 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  31.71 
 
 
117 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  35.51 
 
 
131 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>