33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0165 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0165  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  46.59 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0962  hypothetical protein  46.99 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1281  hypothetical protein  41.43 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150558  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6209  hypothetical protein  36.65 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1250  hypothetical protein  35.97 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1249  hypothetical protein  35.43 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  37.9 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2666  hypothetical protein  36.13 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  34.31 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  45.28 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  29.13 
 
 		 127 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  49.06 
 
 		 128 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6183  hypothetical protein  35.51 
 
 		 126 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  35.56 
 
 		 125 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  26.12 
 
 		 138 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  29.82 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 		 113 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25140  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  29.66 
 
 		 113 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  31.75 
 
 		 127 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  30.7 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  31.36 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  27.5 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  31.67 
 
 		 123 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  31.43 
 
 		 228 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  32.94 
 
 		 117 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  31.9 
 
 		 118 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  35.51 
 
 		 127 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>