54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4295 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0962  hypothetical protein  52.44 
 
 
248 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0165  hypothetical protein  46.59 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1281  hypothetical protein  45.87 
 
 
245 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150558  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6209  hypothetical protein  36.63 
 
 
244 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1249  hypothetical protein  36.48 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106089  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1250  hypothetical protein  34.8 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114148  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  33.87 
 
 
125 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  33.87 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  33.06 
 
 
125 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  29.17 
 
 
127 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  34.62 
 
 
116 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  36.54 
 
 
116 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  27.27 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  35.48 
 
 
113 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  30.8 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  28.88 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  25.97 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2666  hypothetical protein  35.24 
 
 
128 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  33.96 
 
 
116 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  33.96 
 
 
116 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.08 
 
 
121 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
125 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  33.96 
 
 
116 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  26.09 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  33.66 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  33.03 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  36 
 
 
119 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  31.06 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  33.64 
 
 
117 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25140  hypothetical protein  30.28 
 
 
120 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  25.96 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  28.45 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.09 
 
 
129 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.193338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.46 
 
 
113 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
115 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.65 
 
 
136 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
115 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
115 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  35 
 
 
119 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  32.71 
 
 
110 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 
111 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  28.34 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.67 
 
 
129 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  32.17 
 
 
121 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  35.14 
 
 
127 aa  42.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  42.22 
 
 
124 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  46.51 
 
 
124 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>