73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2203 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  264  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  72.44 
 
 
128 aa  197  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  50.39 
 
 
127 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  52.17 
 
 
125 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  53.04 
 
 
125 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  53.04 
 
 
125 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.34 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2666  hypothetical protein  41.03 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6183  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  36.22 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  30.69 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0165  hypothetical protein  45.28 
 
 
253 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.63 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  42.65 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  46.81 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  27.42 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  34.04 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6209  hypothetical protein  29.46 
 
 
244 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.73 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  42.25 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  30.84 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  29.73 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.15 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  32.26 
 
 
245 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  31.68 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  41.07 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  31.58 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  32.71 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0962  hypothetical protein  27.88 
 
 
248 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  30.25 
 
 
228 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  26.61 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  31.53 
 
 
240 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  27.03 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  32.32 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  40.28 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  30.84 
 
 
239 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  32.58 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.78 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.78 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.78 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  30.17 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  24.56 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  28.97 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1250  hypothetical protein  29.46 
 
 
243 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114148  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  37.1 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  28.68 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  28.85 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  26.61 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1281  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150558  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  27.35 
 
 
123 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  27.55 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  29.41 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2917  hypothetical protein  30.08 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.037261  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  25.81 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  23.97 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  28.7 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  30.56 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>