31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6209 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6209  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1281  hypothetical protein  37.75 
 
 
245 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150558  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0165  hypothetical protein  36.65 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0962  hypothetical protein  37.7 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  36.63 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1249  hypothetical protein  36.73 
 
 
243 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106089  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1250  hypothetical protein  34.84 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114148  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  35.14 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  36.94 
 
 
125 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  36.04 
 
 
125 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  29.19 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  36.04 
 
 
125 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  33.04 
 
 
127 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  55.1  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  36.44 
 
 
127 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2666  hypothetical protein  30 
 
 
128 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  29.46 
 
 
127 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
125 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  33.64 
 
 
138 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.65 
 
 
395 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  39.44 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  30.63 
 
 
113 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  36.05 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  36.36 
 
 
124 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.193338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  41.18 
 
 
124 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  29.36 
 
 
135 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  27.03 
 
 
123 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
111 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  35.82 
 
 
117 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>