87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6380 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  279  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  65.29 
 
 
123 aa  176  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2388  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.21 
 
 
118 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0476612  normal  0.436091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0871  hypothetical protein  46.61 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.325277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0692  hypothetical protein  44.44 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  43.33 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  41.67 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0837  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.7 
 
 
122 aa  92  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  42.86 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.48 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.59 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11910  hypothetical protein  40.54 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7081  hypothetical protein  37.19 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0254  hypothetical protein  37.7 
 
 
119 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  38.79 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  38.66 
 
 
237 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  39.66 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  41.38 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25140  hypothetical protein  39.66 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1802  hypothetical protein  35.38 
 
 
261 aa  77.4  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0138028  normal  0.0191363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  35.34 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.96 
 
 
244 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.193338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25510  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  34.71 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.01 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000699293  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.14 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  34.59 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  35.34 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1536  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.62 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354467  normal  0.0455127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5532  hypothetical protein  35.59 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353133  normal  0.762952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20850  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  33.87 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0009  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  29.66 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4615  hypothetical protein  34.88 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
335 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3305  hypothetical protein  30.66 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  32.48 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  30.47 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  32.61 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  32.61 
 
 
125 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  32.61 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  30.47 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  29.31 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  29.6 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  31.67 
 
 
130 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  31.4 
 
 
117 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  32.23 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3298  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.908774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32 
 
 
395 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  28.33 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  29.6 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  34.43 
 
 
116 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0166  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  28.81 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  31.5 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  31.82 
 
 
127 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
125 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  30.89 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  31.36 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  32.58 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6209  hypothetical protein  29.36 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  31.78 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0189  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.574477  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  31.78 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2666  hypothetical protein  30.08 
 
 
128 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  31.78 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  27.12 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  28.81 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  24.06 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  27.73 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  28.12 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  26.19 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  25.98 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  28.21 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>