137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2488 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  246  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  46.88 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  44.17 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  47.01 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  42.61 
 
 
228 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  47.46 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  40.18 
 
 
245 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  40.6 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.35 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.13 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  40.16 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  42.98 
 
 
116 aa  83.6  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  42.98 
 
 
116 aa  83.6  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  37.07 
 
 
240 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  42.74 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  42.98 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  44.88 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.4 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.46 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  37.07 
 
 
239 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  46.4 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  34.09 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  44.07 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  38.52 
 
 
130 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.6 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  38.52 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.13 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  41.27 
 
 
335 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  37.39 
 
 
245 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  39.67 
 
 
253 aa  74.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  41.67 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  36.89 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  36.21 
 
 
241 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  37.78 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  40.68 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  36.76 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  54.1 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  35.9 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  37.61 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  33.09 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  31.11 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  52.46 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  38.33 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  34.07 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  52.11 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  35.54 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  34.03 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  37.9 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.09 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  31.43 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  38.58 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  36.03 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  36.13 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.52 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  34.81 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
238 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  50.82 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  31.72 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  44.87 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  38.66 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  37.93 
 
 
230 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  31.85 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  34.53 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  55.56 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  33.06 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  33.82 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  31.61 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  37.39 
 
 
242 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  35.04 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  33.04 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  34.19 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  36.79 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  47.54 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.13 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  28.87 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  33.78 
 
 
151 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  31.9 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.97 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  34.82 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  33.91 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  30.71 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.17 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  30.22 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  44.26 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>