24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2666 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2666  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  258  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1825  hypothetical protein  48.41 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00267631  normal  0.075549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0814  hypothetical protein  40.94 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5220  hypothetical protein  38.58 
 
 
127 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0944  hypothetical protein  42.52 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1005  hypothetical protein  41.73 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1002  hypothetical protein  41.73 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6183  hypothetical protein  37.3 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2203  hypothetical protein  41.03 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1852  hypothetical protein  35.61 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000761206  hitchhiker  0.00000227001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.88 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0165  hypothetical protein  36.13 
 
 
253 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1281  hypothetical protein  43.37 
 
 
245 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150558  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6209  hypothetical protein  30 
 
 
244 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4295  hypothetical protein  35.24 
 
 
249 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  32.43 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  30.08 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  37.23 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.56 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  33.01 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  51.16 
 
 
127 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  37 
 
 
117 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>