149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  255  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  54.03 
 
 
117 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  51.18 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  50.4 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  49.23 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  52 
 
 
125 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  50.39 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  50.39 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  48.8 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  44.78 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  50.4 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.22 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  53.91 
 
 
137 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.23 
 
 
126 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.67 
 
 
124 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  52.42 
 
 
127 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  45.97 
 
 
121 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  51.61 
 
 
130 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.09 
 
 
125 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.09 
 
 
125 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  50.79 
 
 
131 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.22 
 
 
126 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  47.24 
 
 
128 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  48.8 
 
 
228 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  45.76 
 
 
245 aa  97.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  95.9  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  46.88 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  49.22 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  46.56 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  41.13 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  43.75 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  42.97 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  44.8 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  40.43 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  40.94 
 
 
119 aa  90.5  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  45.8 
 
 
127 aa  89.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  40.94 
 
 
119 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  44.35 
 
 
245 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  41.6 
 
 
240 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  42.06 
 
 
241 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  40.94 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  38.03 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  42.52 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  39.57 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.8 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  38.69 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  40.17 
 
 
239 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  38.85 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  38.73 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  39.37 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  31.51 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  38.4 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  40.8 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  43.06 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  37.01 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  35.77 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.32 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  34.75 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  60.32 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  36.92 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  36.31 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  41.27 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  33.8 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.52 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  39.23 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  38.3 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  34.78 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  39.5 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  41.26 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  40.32 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  34.06 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  34.96 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  39.17 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  37.42 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.97 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  36.18 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  36.8 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  29.29 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  35.62 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  35.42 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  35.07 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  35.43 
 
 
234 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.34 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  34.03 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  31.87 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  38.85 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  32.8 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>