122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1040 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  46.31 
 
 
245 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  49.13 
 
 
228 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  44.44 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  40.16 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  38.46 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  36.18 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  35.89 
 
 
241 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  49.62 
 
 
132 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  51.33 
 
 
116 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  51.33 
 
 
116 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  51.33 
 
 
116 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  44.53 
 
 
132 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  49.56 
 
 
116 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  46.15 
 
 
135 aa  96.3  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  46.02 
 
 
116 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  59.72 
 
 
138 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  45.87 
 
 
117 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  33.47 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  40.52 
 
 
119 aa  78.2  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  39.5 
 
 
119 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.62 
 
 
126 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.84 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  44.63 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.25 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  39.67 
 
 
123 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.62 
 
 
126 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  42.15 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.33 
 
 
126 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
125 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
124 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  39.42 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  37.23 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  44.92 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  32.5 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  41.09 
 
 
127 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  37.21 
 
 
121 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  39.52 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  38.28 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  38.52 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  42.99 
 
 
117 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 
113 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  41.94 
 
 
120 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.1 
 
 
395 aa  62  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  42.31 
 
 
127 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.74 
 
 
115 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.74 
 
 
115 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
113 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.74 
 
 
115 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  33.61 
 
 
120 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
129 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  30.43 
 
 
142 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  40.15 
 
 
335 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  32.73 
 
 
113 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  33.61 
 
 
128 aa  58.5  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.21 
 
 
111 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3567  hypothetical protein  31.72 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  37.07 
 
 
118 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  39.53 
 
 
137 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  30.92 
 
 
153 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
118 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
118 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  31.54 
 
 
153 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  37.14 
 
 
145 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  33.57 
 
 
144 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  32.62 
 
 
145 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  32.19 
 
 
153 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 
136 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  31.17 
 
 
153 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  38.74 
 
 
115 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  34.68 
 
 
127 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.94 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.14 
 
 
125 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  34.46 
 
 
146 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  36.13 
 
 
136 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  31.69 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05900  hypothetical protein  48.53 
 
 
63 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  33.62 
 
 
114 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  35.83 
 
 
129 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  33.59 
 
 
123 aa  48.9  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  29.33 
 
 
149 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  34.11 
 
 
127 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  34.51 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  33.91 
 
 
110 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  34.04 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  32.8 
 
 
125 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  34.92 
 
 
124 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  28.93 
 
 
138 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 
129 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  42.03 
 
 
150 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>