More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  100 
 
 
217 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  49.5 
 
 
225 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  49 
 
 
218 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  51.69 
 
 
231 aa  181  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.51 
 
 
219 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  49.25 
 
 
224 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.32 
 
 
235 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  44.02 
 
 
232 aa  142  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  40.44 
 
 
235 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  42.72 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.32 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  44.78 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  42.11 
 
 
236 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.84 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  34.78 
 
 
234 aa  111  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  36.08 
 
 
223 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  36.27 
 
 
236 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  33.17 
 
 
449 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  48.25 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  38.14 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22650  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.45 
 
 
103 aa  72  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.96 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  46.38 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3519  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  50.79 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.777034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.96 
 
 
120 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1724  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.56 
 
 
103 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.37 
 
 
97 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1320  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.88 
 
 
113 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197021  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.68 
 
 
93 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.99 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.18 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  36 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  47.46 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.71 
 
 
93 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.75 
 
 
94 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0727  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.54 
 
 
101 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.856744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2387  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  43.16 
 
 
99 aa  62.8  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1646  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.32 
 
 
116 aa  62.4  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0328743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.57 
 
 
94 aa  62  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1266  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  49.15 
 
 
109 aa  62  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.421777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1636  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.21 
 
 
135 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.113224  normal  0.269211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3388  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  39 
 
 
119 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0700  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.36 
 
 
96 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000704537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  47.69 
 
 
92 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0497  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.56 
 
 
114 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.96 
 
 
96 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1768  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.18 
 
 
93 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  46.15 
 
 
92 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0099  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.62 
 
 
101 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0703  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.54 
 
 
101 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2684  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.29 
 
 
89 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.819966  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31220  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.2 
 
 
96 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12116  normal  0.529511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  34.23 
 
 
117 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  31.71 
 
 
127 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  32.54 
 
 
129 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  33.8 
 
 
145 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4024  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  43.75 
 
 
117 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0254  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  44.07 
 
 
90 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.569153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  36.44 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.89 
 
 
99 aa  55.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  37.31 
 
 
96 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4166  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.19 
 
 
117 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.19 
 
 
117 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0793  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40 
 
 
98 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  31.21 
 
 
146 aa  54.7  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  28.47 
 
 
141 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1125  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  41.89 
 
 
113 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1232  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.99 
 
 
93 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187262  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11183  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  32.94 
 
 
94 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0180  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.62 
 
 
133 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 
136 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1412  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  43.08 
 
 
104 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0351237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0417  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.26 
 
 
116 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0306191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1535  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.36 
 
 
94 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000224149  normal  0.214474 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3581  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.36 
 
 
96 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0169  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.98 
 
 
103 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.46 
 
 
118 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3534  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.08 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1692  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.91 
 
 
109 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  36.61 
 
 
116 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3922  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.56 
 
 
96 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450705  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0006  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.46 
 
 
97 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  41.07 
 
 
94 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0408  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  37.62 
 
 
100 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0568547  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  41.35 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  31.21 
 
 
144 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4534  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.78 
 
 
126 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221765  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1757  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32 
 
 
125 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0401  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.48 
 
 
112 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.685477  hitchhiker  0.00013147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11184  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.47 
 
 
94 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000707636  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2429  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.77 
 
 
132 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101892  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2978  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.78 
 
 
125 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0423  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.63 
 
 
102 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0873701  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2208  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.47 
 
 
95 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0290031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3378  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.97 
 
 
114 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.563768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>