29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14470  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  100 
 
 
234 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.718211  normal  0.251012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2086  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  68.1 
 
 
256 aa  318  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349534  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0321  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  60.44 
 
 
224 aa  268  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0452817  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.65 
 
 
219 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0980  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.19 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22560  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  37.77 
 
 
232 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.17 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.02 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  34.78 
 
 
217 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0882  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  36.7 
 
 
211 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00490337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  30 
 
 
225 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3393  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.71 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  29.63 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3428  hypothetical protein  30.74 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0396  hypothetical protein  28.97 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0267172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  31.69 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3546  hypothetical protein  28.95 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22650  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35 
 
 
103 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.85 
 
 
94 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0727  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.26 
 
 
101 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.856744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1724  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.1 
 
 
103 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0194781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0947  hypothetical protein  33.1 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29375  predicted protein  31.17 
 
 
127 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.395144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3968  hypothetical protein  29.25 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  31.76 
 
 
82 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1862  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.84 
 
 
99 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.731074  normal  0.634573 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1218  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.8 
 
 
93 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  26.73 
 
 
97 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  45.1 
 
 
417 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>