90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1410 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  271  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  70 
 
 		 245 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  59.72 
 
 		 253 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  63.33 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  45.83 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  59.7 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  59.32 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  58.06 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  59.32 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  58.06 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  58.06 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  49.38 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  60.32 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  44 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  43.68 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  60 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  54.84 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  54.1 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55 
 
 		 238 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  49.38 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  50.82 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  54.1 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  53.97 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  53.57 
 
 		 230 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  48.1 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.9 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  39.02 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.17 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.17 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.14 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  49.32 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  51.52 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  50.68 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  33.55 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  51.47 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  42.42 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.55 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.12 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.3 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  49.15 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  35.58 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  49.15 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  49.25 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.72 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  43.94 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  48.21 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  47.89 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  43.48 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  53.57 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  44.29 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  39.18 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05900  hypothetical protein  52.54 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  45.76 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.27 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  50.94 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  47.27 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  39.39 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  48.15 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2041  hypothetical protein  49.09 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  48.28 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 		 335 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  41.77 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  46.03 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  48.21 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  46.43 
 
 		 395 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  32.26 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3562  hypothetical protein  47.83 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00833026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3635  hypothetical protein  47.83 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276283  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  28.97 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  46.43 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3567  hypothetical protein  47.83 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.64 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  40.58 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  44.83 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  32 
 
 		 146 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  37.97 
 
 		 153 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  40.35 
 
 		 234 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.3 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  37.14 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.45 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0642581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>