116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3034 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  80.39 
 
 		 153 aa  256  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  74.51 
 
 		 153 aa  243  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  59.74 
 
 		 145 aa  181  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  60.78 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  54.97 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  56.29 
 
 		 144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  53.64 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  50.99 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  51.66 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  49.01 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  50.33 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  49.01 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  45.81 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  47.02 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  41.88 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25860  hypothetical protein  39.47 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  35.95 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  40.26 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  38.12 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  37.97 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  37.67 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  35.1 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  35 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1502  hypothetical protein  53.95 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.364685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  35.62 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  33.11 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  33.54 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  33.74 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  37.41 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  31.97 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.16 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  34.34 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  33.78 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  28.92 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  32 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  35.19 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  48.1 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  30.67 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  30.67 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.79 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  30.67 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.79 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.79 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  33.55 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  30.67 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  30.41 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  34.57 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  33.77 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  34 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  32.65 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  33.57 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  34.87 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  29.53 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  30.82 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  31.08 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3076  hypothetical protein  32.91 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  31.95 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  30.92 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2530  hypothetical protein  29.41 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  30.26 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.05 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  36.79 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  30.13 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  31.17 
 
 		 253 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.38 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  37.7 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  42.31 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  31.13 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  32.88 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.38 
 
 		 231 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.45 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  30.2 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  29.05 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.48 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.33 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.14 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  27.03 
 
 		 217 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  31.33 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  28.29 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.89 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.68 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  29.73 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>