62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1108 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1108  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  47.86 
 
 
239 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.64 
 
 
238 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  45.38 
 
 
240 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  47.26 
 
 
241 aa  187  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  31.98 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  30.97 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  31.54 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  31.69 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  33.86 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  33.86 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  37.93 
 
 
123 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  36.21 
 
 
117 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  35.94 
 
 
127 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  53.57 
 
 
138 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  36.21 
 
 
116 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6182  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
123 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4061  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.45 
 
 
126 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  30.17 
 
 
116 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5109  hypothetical protein  32.11 
 
 
110 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532825  normal  0.118566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 
126 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
115 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
115 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
115 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
126 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5883  hypothetical protein  33.04 
 
 
235 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  33.85 
 
 
135 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
124 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.48 
 
 
113 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  31.9 
 
 
125 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
335 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  32.52 
 
 
119 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  35.9 
 
 
115 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1066  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.36 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.5 
 
 
125 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  31.03 
 
 
125 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  33.61 
 
 
127 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  35.05 
 
 
127 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
129 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02690  hypothetical protein  29.2 
 
 
143 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475561  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
113 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  28.32 
 
 
124 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  31.62 
 
 
242 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0448  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.89 
 
 
125 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.25753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
119 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  34.43 
 
 
136 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  34.17 
 
 
117 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10670  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  34.91 
 
 
217 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0658064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  22.13 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  31.4 
 
 
121 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
140 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000699293  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  34.43 
 
 
121 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.19 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  27.59 
 
 
130 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.93 
 
 
244 aa  42  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.193338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>