94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3635 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3562  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00833026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3635  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276283  normal  0.511136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3567  hypothetical protein  74.29 
 
 
210 aa  260  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  40.87 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0555  hypothetical protein  36.84 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  37.07 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5137  hypothetical protein  36.84 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815248  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  36.72 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  37.93 
 
 
120 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22640  hypothetical protein  37.07 
 
 
119 aa  58.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
335 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  38.1 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  37.68 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  38.1 
 
 
116 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  38.1 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5882  hypothetical protein  36.52 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1040  hypothetical protein  36.76 
 
 
253 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  36.44 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  38.53 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5458  hypothetical protein  31.16 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0300  hypothetical protein  35.25 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  33.64 
 
 
116 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  33.56 
 
 
245 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25540  hypothetical protein  35 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  33.64 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  33.96 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1149  hypothetical protein  36 
 
 
449 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0943899  normal  0.525686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  37.93 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  36.22 
 
 
127 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  36.69 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  33.83 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  40 
 
 
228 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  33.87 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3284  hypothetical protein  34.51 
 
 
234 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2066  hypothetical protein  36.52 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5075  hypothetical protein  43.21 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.899338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.73 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  31.47 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  44 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5116  hypothetical protein  36.21 
 
 
240 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  33.94 
 
 
134 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  32.12 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
119 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7424  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 
115 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 
115 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  30.28 
 
 
113 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1407  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.78 
 
 
231 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 
129 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 
115 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1972  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
125 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.41866  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2315  hypothetical protein  34.82 
 
 
239 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  36.44 
 
 
245 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7827  hypothetical protein  37.39 
 
 
241 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25380  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606308  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05900  hypothetical protein  52.83 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06250  hypothetical protein  32.35 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.938865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  29.75 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  33.88 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  34.78 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1116  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.23 
 
 
238 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3034  hypothetical protein  42.11 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0240001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1906  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.04 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457322  normal  0.154626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  40.98 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  46.67 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.45 
 
 
121 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  34.35 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19060  hypothetical protein  34.43 
 
 
132 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.265837  normal  0.18258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  38.6 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1410  hypothetical protein  47.83 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2187  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
118 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0642581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  29.84 
 
 
132 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3282  hypothetical protein  45.45 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  42.67 
 
 
144 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.23 
 
 
113 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.73 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6978  hypothetical protein  28.97 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  32.06 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0586  Pterin-4a-carbinolamine dehydratase-like protein  33.33 
 
 
225 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 
118 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0914  hypothetical protein  31.97 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3824  hypothetical protein  33.93 
 
 
417 aa  41.6  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1240  hypothetical protein  44.16 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10816  hypothetical protein  30.63 
 
 
115 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.399339  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1956  hypothetical protein  31.88 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1922  hypothetical protein  53.45 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0447405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0503  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.68 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.012909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>