71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1814 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1814  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
172 aa  348  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.52 
 
 
136 aa  188  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374445  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1512  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2176  hypothetical protein  31.51 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0578435  normal  0.0672972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4019  hypothetical protein  29.86 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4094  hypothetical protein  29.86 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4249  hypothetical protein  29.86 
 
 
116 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605375  normal  0.0498111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4521  hypothetical protein  29.45 
 
 
116 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3971  hypothetical protein  28.36 
 
 
117 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0366  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9281  hypothetical protein  28.37 
 
 
113 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1466  hypothetical protein  31.94 
 
 
125 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26170  hypothetical protein  33.58 
 
 
127 aa  57.8  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0450608  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.09 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5763  hypothetical protein  29.73 
 
 
228 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642959  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3766  hypothetical protein  27.14 
 
 
117 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.5 
 
 
113 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4549  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
115 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1340  hypothetical protein  30 
 
 
120 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1463  hypothetical protein  27.11 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
115 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4637  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
115 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2260  hypothetical protein  27.71 
 
 
144 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4252  hypothetical protein  29.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6280  hypothetical protein  28.95 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.896361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4350  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.08 
 
 
126 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.692223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3326  hypothetical protein  30.07 
 
 
127 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3858  hypothetical protein  32.26 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0149643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3598  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
124 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22500  hypothetical protein  34.51 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.831354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4247  hypothetical protein  26.85 
 
 
127 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1719  hypothetical protein  28.65 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6347  hypothetical protein  28.29 
 
 
127 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3097  hypothetical protein  26.51 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1526  hypothetical protein  34.75 
 
 
124 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637677  normal  0.757551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19330  hypothetical protein  27.33 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193262  normal  0.367636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3672  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.08 
 
 
129 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2704  hypothetical protein  25.29 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.034837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4667  hypothetical protein  34.9 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0764382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1629  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2587  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869022  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5848  hypothetical protein  27.78 
 
 
117 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000947774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3931  hypothetical protein  29.63 
 
 
127 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2488  hypothetical protein  26.35 
 
 
123 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2585  hypothetical protein  28.14 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1261  hypothetical protein  25.17 
 
 
127 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  25.53 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7567  hypothetical protein  27.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3812  hypothetical protein  24.4 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3008  hypothetical protein  23.03 
 
 
141 aa  44.7  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000261512  hitchhiker  0.000130504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5162  hypothetical protein  28.66 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3616  hypothetical protein  28.37 
 
 
245 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3966  hypothetical protein  28.36 
 
 
136 aa  44.7  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0799  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.19 
 
 
395 aa  44.7  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.95 
 
 
118 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0380  hypothetical protein  24.85 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.544251  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2836  hypothetical protein  24.7 
 
 
145 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0226  hypothetical protein  26.03 
 
 
127 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
119 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5700  hypothetical protein  24.84 
 
 
128 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1976  hypothetical protein  26.45 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6944  hypothetical protein  29.49 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0150  hypothetical protein  31.13 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.36 
 
 
111 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5426  hypothetical protein  43.64 
 
 
134 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  24.11 
 
 
141 aa  40.8  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3382  hypothetical protein  24.48 
 
 
121 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000231795  hitchhiker  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5068  hypothetical protein  29.14 
 
 
150 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.560594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4370  phosphoribosyltransferase  24.49 
 
 
335 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  normal  0.281198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>