137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0566 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 
318 aa  661    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  56.27 
 
 
307 aa  347  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0568  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  48.17 
 
 
314 aa  323  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  50.53 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0883  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.53 
 
 
220 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111412  hitchhiker  0.00000000224272 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49508  predicted protein  38.79 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.74 
 
 
130 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.77 
 
 
133 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.48 
 
 
123 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.23 
 
 
127 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.53 
 
 
130 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2810  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.88 
 
 
134 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.33 
 
 
143 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.18 
 
 
121 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2727  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.4 
 
 
124 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  24.47 
 
 
1208 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.97 
 
 
127 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.58 
 
 
127 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.25 
 
 
131 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.23 
 
 
134 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.46 
 
 
143 aa  56.2  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2418  hypothetical protein  30.23 
 
 
123 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.33 
 
 
135 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.09 
 
 
135 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0696  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.63 
 
 
112 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0820  CbiX  34.48 
 
 
128 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  26.47 
 
 
375 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1136  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.94 
 
 
125 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.67 
 
 
133 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  25.57 
 
 
236 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.47 
 
 
128 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  30.84 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.35 
 
 
127 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5800  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.48 
 
 
127 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.27 
 
 
127 aa  52.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  35.37 
 
 
142 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  30.84 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1302  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.5 
 
 
122 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.22 
 
 
253 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.83 
 
 
126 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.56 
 
 
127 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  24.07 
 
 
236 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.16 
 
 
129 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.4 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  24.07 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  24.07 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.62 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2220  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.05 
 
 
135 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186484 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  36.05 
 
 
134 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.01 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  24.54 
 
 
236 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.42 
 
 
127 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.78 
 
 
238 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0467  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.76 
 
 
122 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  23.61 
 
 
236 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0340  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.78 
 
 
121 aa  49.7  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.95 
 
 
127 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.48 
 
 
143 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2228  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.95 
 
 
126 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.326708  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.48 
 
 
150 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0119  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  29.67 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2172  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.7 
 
 
125 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.130516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.07 
 
 
133 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.48 
 
 
146 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.79 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.92 
 
 
127 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.92 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3641  hypothetical protein  31.4 
 
 
123 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1858  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.18 
 
 
127 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2469  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.18 
 
 
127 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.82 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.09 
 
 
146 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.81 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3536  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.4 
 
 
137 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0117443 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2474  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.18 
 
 
127 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0828  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.39 
 
 
123 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0171031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2222  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.44 
 
 
123 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.910475  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  26.29 
 
 
379 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.15 
 
 
159 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  27.17 
 
 
349 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2682  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.88 
 
 
123 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3304  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.41 
 
 
128 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  27.74 
 
 
259 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  23.61 
 
 
236 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2518  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.95 
 
 
127 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.15 
 
 
471 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  23.61 
 
 
236 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0669  cbiX protein  34.48 
 
 
128 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.11 
 
 
137 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.76 
 
 
127 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2342  cbiX protein  34.48 
 
 
128 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  25.47 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  26.74 
 
 
127 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2943  cbiX protein  34.48 
 
 
128 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1012  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  34.48 
 
 
128 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1019  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  34.48 
 
 
128 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1656  cbiX protein  34.48 
 
 
128 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  28.74 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.62 
 
 
250 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807173  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  30.53 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>