78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0568 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0568  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 314 aa  644    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  61.48 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  48.96 
 
 		 318 aa  320  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.82 
 
 		 307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0883  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.33 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111412  hitchhiker  0.00000000224272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  25 
 
 		 1208 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.63 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.13 
 
 		 134 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.44 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.37 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.27 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.84 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.44 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.11 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.14 
 
 		 127 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.93 
 
 		 130 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.14 
 
 		 127 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.14 
 
 		 127 aa  53.9  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.67 
 
 		 143 aa  53.1  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.22 
 
 		 146 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.91 
 
 		 127 aa  52.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0467  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 		 122 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220306  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0696  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.18 
 
 		 112 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.87 
 
 		 133 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49508  predicted protein  31.25 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  21.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  21.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.58 
 
 		 143 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.03 
 
 		 146 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  21.56 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.03 
 
 		 146 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.94 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882429 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.37 
 
 		 128 aa  49.7  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.6 
 
 		 130 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  21.1 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3641  hypothetical protein  29.07 
 
 		 123 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  25.34 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3536  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.74 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.74 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  21.1 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.84 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  25.84 
 
 		 127 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2810  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.73 
 
 		 134 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2727  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.74 
 
 		 124 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.74 
 
 		 150 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  21.1 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  22.22 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0119  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  28.72 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.68 
 
 		 247 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.42 
 
 		 127 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2172  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.47 
 
 		 125 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.130516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2418  hypothetical protein  22.09 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  29 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0828  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.99 
 
 		 123 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0171031 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  25.56 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.12 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  23.33 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  22.52 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  23.6 
 
 		 443 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.68 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.17 
 
 		 418 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  28.26 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  24.5 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  23.6 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.05 
 
 		 250 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  28.26 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.74 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0340  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.88 
 
 		 121 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.26 
 
 		 135 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1136  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.56 
 
 		 125 aa  42.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.56 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.27 
 
 		 416 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2222  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.71 
 
 		 123 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.910475  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2682  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.71 
 
 		 123 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2686  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 		 137 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1231  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.69 
 
 		 238 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.14 
 
 		 248 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>