143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1569 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 
307 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  58.18 
 
 
318 aa  339  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0568  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.82 
 
 
314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.41 
 
 
330 aa  286  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.06 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0883  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.9 
 
 
220 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111412  hitchhiker  0.00000000224272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.66 
 
 
130 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.83 
 
 
128 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  32.68 
 
 
251 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  32.68 
 
 
251 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.14 
 
 
130 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  33.99 
 
 
251 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49508  predicted protein  35.29 
 
 
317 aa  62.4  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  30.92 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  30.92 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  31.37 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  32.03 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.22 
 
 
121 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  29.05 
 
 
251 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.18 
 
 
143 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.09 
 
 
127 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.31 
 
 
127 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0119  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  30.34 
 
 
332 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2708  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.96 
 
 
124 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  31.37 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.2 
 
 
132 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.96 
 
 
134 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.58 
 
 
127 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.78 
 
 
150 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  29.45 
 
 
375 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.01 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  34.88 
 
 
142 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.7 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.56 
 
 
133 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.68 
 
 
123 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3641  hypothetical protein  30.17 
 
 
123 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.41 
 
 
127 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  23.66 
 
 
1208 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.09 
 
 
146 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.01 
 
 
135 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.33 
 
 
146 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.09 
 
 
146 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.58 
 
 
250 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.72 
 
 
127 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.41 
 
 
127 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0820  CbiX  36.05 
 
 
128 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.33 
 
 
247 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.87 
 
 
250 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807173  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2418  hypothetical protein  29.07 
 
 
123 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1302  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.52 
 
 
122 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.79 
 
 
309 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0278734 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  28.05 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1136  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.11 
 
 
125 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295149  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0340  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.23 
 
 
121 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.33 
 
 
143 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.16 
 
 
127 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2222  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.55 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.910475  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.94 
 
 
120 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.81 
 
 
127 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.59 
 
 
133 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  29.01 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  30.52 
 
 
401 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.16 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.93 
 
 
550 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  26.73 
 
 
443 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  32.94 
 
 
127 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.61 
 
 
127 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1945  hypothetical protein  29.67 
 
 
127 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.982544  normal  0.0685142 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2682  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.41 
 
 
123 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.14 
 
 
127 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.03 
 
 
143 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.94 
 
 
159 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3536  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.12 
 
 
137 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0117443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0529  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.69 
 
 
157 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.584257  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0696  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.91 
 
 
112 aa  49.3  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2598  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.83 
 
 
131 aa  49.3  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159371 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0669  cbiX protein  35.56 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1172  CbiX  35.56 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0919733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1832  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.71 
 
 
116 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.42293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 
127 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2342  cbiX protein  35.56 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2943  cbiX protein  35.56 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1012  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  35.56 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1019  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  35.56 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1656  cbiX protein  35.56 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.07 
 
 
553 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.88 
 
 
471 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2727  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.93 
 
 
124 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2228  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.18 
 
 
126 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.326708  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0828  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.74 
 
 
123 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0171031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.03 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.53 
 
 
127 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  31.03 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.46 
 
 
133 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0467  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.76 
 
 
122 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3304  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 
128 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  25.89 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.07 
 
 
135 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.45 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.07 
 
 
410 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>