136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0681 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  66.92 
 
 
133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  62.31 
 
 
135 aa  167  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  52.63 
 
 
133 aa  154  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  55.64 
 
 
143 aa  152  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  57.25 
 
 
135 aa  143  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  47.62 
 
 
130 aa  124  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  43.65 
 
 
130 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  40.94 
 
 
131 aa  103  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  40 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.71 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.28 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.99 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.86 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.65 
 
 
291 aa  70.1  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.58 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.81 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.6 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0696  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.2 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.15 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  32.84 
 
 
289 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.56 
 
 
301 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.09 
 
 
299 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.93 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.41 
 
 
330 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.78 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  31.78 
 
 
514 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.45 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  30.4 
 
 
253 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  24.03 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.77 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.27 
 
 
233 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.03 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.82 
 
 
318 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2708  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.22 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0820  CbiX  24.14 
 
 
128 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.88 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  29.03 
 
 
250 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  24.41 
 
 
379 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0568  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.87 
 
 
314 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2727  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.05 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.59 
 
 
307 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  23.26 
 
 
236 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2810  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.3 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.19 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2418  hypothetical protein  20.83 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  22.83 
 
 
400 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  24.56 
 
 
375 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  22.83 
 
 
401 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.59 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  23.26 
 
 
236 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  23.26 
 
 
236 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0529  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.08 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.584257  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  27.97 
 
 
337 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0669  cbiX protein  25.29 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1172  CbiX  25.29 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0919733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  24.41 
 
 
368 aa  48.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.81 
 
 
123 aa  48.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.19 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2342  cbiX protein  25.29 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2943  cbiX protein  25.29 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1012  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  25.29 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1019  putative sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX  25.29 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1656  cbiX protein  25.29 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0883  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.82 
 
 
220 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111412  hitchhiker  0.00000000224272 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  23.93 
 
 
337 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3641  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1136  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.96 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.14 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.67 
 
 
253 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  27.5 
 
 
236 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3731  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.58 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000108177  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.95 
 
 
252 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  25.21 
 
 
142 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  28.57 
 
 
479 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  23.26 
 
 
236 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  23.26 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0340  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.3 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2222  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  18.39 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.910475  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6101  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.67 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32194  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  22.48 
 
 
236 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1812  hypothetical protein  25.64 
 
 
365 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.71 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2172  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.88 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.130516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2682  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  18.39 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49508  predicted protein  28.93 
 
 
317 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.54 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1858  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.59 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2518  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.44 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2469  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.59 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3493  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.4 
 
 
245 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2474  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.59 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2386  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.44 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5800  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.59 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.41 
 
 
309 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  22.48 
 
 
236 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.4 
 
 
258 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.99 
 
 
247 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>