33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0262 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  75.69 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  75.27 
 
 		 291 aa  449  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  74.31 
 
 		 301 aa  443  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  51.66 
 
 		 514 aa  263  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  45.72 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  42.86 
 
 		 479 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.76 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.162981 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3458  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.42 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.83 
 
 		 135 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.84 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.56 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.5 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.82 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.13 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.78 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.3 
 
 		 130 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.61 
 
 		 130 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.71 
 
 		 131 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1566  hypothetical protein  22.91 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.78 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.55 
 
 		 129 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.03 
 
 		 146 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.41 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.29 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.94 
 
 		 146 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.59 
 
 		 143 aa  46.2  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.29 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1835  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.35 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171582  normal  0.548174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.12 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.56 
 
 		 238 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  25.38 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>