36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1053 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  88.04 
 
 		 301 aa  541  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  77.39 
 
 		 291 aa  463  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  75.69 
 
 		 289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  53.07 
 
 		 514 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  45.35 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  42.91 
 
 		 479 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.4 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.162981 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3458  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.8 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.59 
 
 		 135 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.66 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.09 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.71 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.78 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.94 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.14 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.79 
 
 		 130 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.01 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.66 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.24 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1566  hypothetical protein  24.24 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.1 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  28.24 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  25.74 
 
 		 1208 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.34 
 
 		 130 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25 
 
 		 146 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0657  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.12 
 
 		 230 aa  43.5  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415953  normal  0.211128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.36 
 
 		 238 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.66 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.89 
 
 		 146 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  29.63 
 
 		 142 aa  42.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  28.89 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.45 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>