33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3212 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  88.04 
 
 		 299 aa  541  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  76.92 
 
 		 291 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  74.31 
 
 		 289 aa  443  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  52.94 
 
 		 514 aa  279  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  47.21 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  43.28 
 
 		 479 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.8 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.162981 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3458  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.98 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.84 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.86 
 
 		 143 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.56 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.52 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.62 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.68 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.12 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.33 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.57 
 
 		 233 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.64 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.24 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1566  hypothetical protein  23.64 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.34 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  28.24 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.28 
 
 		 131 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.56 
 
 		 143 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.28 
 
 		 130 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  23.76 
 
 		 1208 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2795  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.22 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.048407  hitchhiker  0.00112635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  24.38 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 		 234 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  27.2 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.61 
 
 		 238 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.94 
 
 		 146 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>