26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3047 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 233 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1566  hypothetical protein  80 
 
 		 229 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  80 
 
 		 229 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2332  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  47.09 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1835  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.39 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171582  normal  0.548174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3171  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  42.61 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  28.48 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  25.36 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  24.45 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.44 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.45 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.13 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  27.37 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.12 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.3 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2821  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.43 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2740  hypothetical protein  32.32 
 
 		 142 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.12 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3126  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.65 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.79 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.65 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.45 
 
 		 531 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0272  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.9 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.243812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0262  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.9 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1128  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.29 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>