32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0274 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  971    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  35.66 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  50.95 
 
 		 253 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  43.28 
 
 		 301 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  42.91 
 
 		 299 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.18 
 
 		 291 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  203  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1132  hypothetical protein  33.82 
 
 		 268 aa  93.6  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3213  hypothetical protein  31.48 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.976999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1054  hypothetical protein  29.91 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2178  hypothetical protein  31.85 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0261  hypothetical protein  30.91 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.32 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.9 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.162981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.09 
 
 		 233 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3458  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.51 
 
 		 269 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1566  hypothetical protein  27.92 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.92 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  39.08 
 
 		 146 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  37.93 
 
 		 146 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.78 
 
 		 146 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2332  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.32 
 
 		 230 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.57 
 
 		 133 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  35.29 
 
 		 1208 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.4 
 
 		 288 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.74 
 
 		 133 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.56 
 
 		 143 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.63 
 
 		 150 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.23 
 
 		 135 aa  44.3  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.33 
 
 		 143 aa  43.9  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1835  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.35 
 
 		 244 aa  43.9  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171582  normal  0.548174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.42 
 
 		 121 aa  43.1  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>