170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1511 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  100 
 
 
146 aa  291  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  91.78 
 
 
146 aa  229  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  94.52 
 
 
146 aa  223  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  74.67 
 
 
150 aa  196  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  66.21 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.47 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.17 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.25 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.97 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.8 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.58 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.78 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0696  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.64 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.69 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.66 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.47 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  42.22 
 
 
337 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.86 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.17 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  41.11 
 
 
337 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.58 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.66 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.14 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.91 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.69 
 
 
233 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.5 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  36.25 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0828  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.37 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0171031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.47 
 
 
275 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  32.17 
 
 
253 aa  59.3  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.43 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3304  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  42.17 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.57 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.07 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1858  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.71 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2469  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.71 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.75 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2474  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.71 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0529  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.96 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.584257  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.71 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  25 
 
 
379 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.46 
 
 
248 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2172  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.8 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.130516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.06 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  35.8 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2518  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.49 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  31.11 
 
 
443 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  34.12 
 
 
251 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  25.71 
 
 
401 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.08 
 
 
247 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.77 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.91 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.57 
 
 
250 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.9 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  33.33 
 
 
251 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  33.33 
 
 
251 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0820  CbiX  32.93 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  33.33 
 
 
251 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.63 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  32.14 
 
 
375 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.09 
 
 
307 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  39.08 
 
 
479 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6101  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.83 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32194  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.97 
 
 
277 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0340  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.76 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5800  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3536  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.86 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0117443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  30.86 
 
 
251 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3731  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.12 
 
 
125 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000108177  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.86 
 
 
250 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  30.86 
 
 
236 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1832  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.4 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.42293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2810  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.33 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.71 
 
 
297 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.65 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  32.1 
 
 
236 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3641  hypothetical protein  31.76 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  27.27 
 
 
359 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.1 
 
 
236 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.4 
 
 
248 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  34.15 
 
 
534 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0568  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.79 
 
 
314 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  32.1 
 
 
250 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.89 
 
 
418 aa  50.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2418  hypothetical protein  30.12 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.1 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.11 
 
 
357 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  30.86 
 
 
236 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.04 
 
 
410 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2682  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.38 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>