27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0217 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 229 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1566  hypothetical protein  97.82 
 
 		 229 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  80.48 
 
 		 233 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2332  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  48 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1835  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.44 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171582  normal  0.548174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3171  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.33 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.47 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  27.92 
 
 		 479 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  29.73 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.7 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.42 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  22.98 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.64 
 
 		 301 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.79 
 
 		 127 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  24.65 
 
 		 514 aa  48.5  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.24 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1128  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.67 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  41.57 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.33 
 
 		 127 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.08 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.41 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.162981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.33 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.01 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.49 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0381  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.36 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.36 
 
 		 127 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>