167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0786 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  91.78 
 
 
146 aa  225  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  91.78 
 
 
146 aa  221  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  73.33 
 
 
150 aa  201  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  65.75 
 
 
143 aa  173  7e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  38.57 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.17 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.25 
 
 
128 aa  84  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  38.13 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.75 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.56 
 
 
135 aa  76.6  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0696  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.11 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.28 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.29 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.51 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2245  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.62 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.177211  hitchhiker  0.00554027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.99 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07101  hypothetical protein  40 
 
 
337 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129916  normal  0.330282 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.39 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.75 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.87 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.69 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0086  hypothetical protein  38.89 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.639157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0938  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.28 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.35 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.71 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.25 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  35 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0828  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.68 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0171031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  40 
 
 
253 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.71 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0981  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.89 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  34.57 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.5 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0529  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.93 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.584257  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.44 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1858  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.55 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2469  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.55 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2474  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.55 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.1 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.18 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3304  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.55 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.77 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.08 
 
 
247 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.06 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.33 
 
 
275 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.03 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07021  hypothetical protein  24.29 
 
 
400 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1149  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.8 
 
 
250 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.427856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  34.12 
 
 
251 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0646  hypothetical protein  24.29 
 
 
379 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6101  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.18 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32194  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.35 
 
 
248 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  33.33 
 
 
251 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  33.33 
 
 
251 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  33.33 
 
 
251 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  33.33 
 
 
251 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1832  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.26 
 
 
116 aa  53.9  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.42293  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07121  hypothetical protein  30 
 
 
375 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.29 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06731  hypothetical protein  25 
 
 
401 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2518  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.05 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.31 
 
 
248 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.09 
 
 
307 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 
122 aa  52  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  30.86 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  30.86 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2172  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.1 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.130516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3731  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.12 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000108177  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0340  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.38 
 
 
121 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2113  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.42 
 
 
123 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12211  hypothetical protein  28.24 
 
 
359 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2641  hypothetical protein  26.97 
 
 
443 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3536  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.4 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0117443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.63 
 
 
250 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  30.86 
 
 
251 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.27 
 
 
248 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.37 
 
 
277 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49508  predicted protein  34.52 
 
 
317 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5800  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.09 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0843  hypothetical protein  29.76 
 
 
368 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0820  CbiX  28.05 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  28.4 
 
 
236 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.05 
 
 
297 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1302  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.41 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  32.1 
 
 
250 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.63 
 
 
236 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  29.63 
 
 
236 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.4 
 
 
321 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0568  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.03 
 
 
314 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.206541 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  32.58 
 
 
349 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.63 
 
 
244 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2810  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.71 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  30.92 
 
 
479 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0883  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.59 
 
 
220 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111412  hitchhiker  0.00000000224272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4477  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.56 
 
 
263 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657988  decreased coverage  0.000679447 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.1 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.4 
 
 
309 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>