34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4642 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  297  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  71.62 
 
 
154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  68.92 
 
 
162 aa  200  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  68.92 
 
 
154 aa  199  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  68.97 
 
 
145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  48.23 
 
 
246 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  44.33 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.82 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  38.68 
 
 
432 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  30.26 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  40.91 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  40.91 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.87 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  40.19 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  35.48 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  31.07 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  29.49 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  36.56 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.87 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  30.34 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  26.73 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3703  Polyketide cyclase/dehydrase  23.3 
 
 
153 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0811  hypothetical protein  28.75 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3666  hypothetical protein  26.61 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  31.82 
 
 
194 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>