35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4553 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
161 aa  327  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  52.9 
 
 
158 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  51.01 
 
 
153 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  50.34 
 
 
153 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  51.06 
 
 
147 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.14 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  44.14 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  32.91 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  32.91 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  29.94 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  32.91 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  36.18 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  33.12 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  34.87 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  36.36 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  40.18 
 
 
171 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  35.45 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  36.89 
 
 
145 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.76 
 
 
150 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.03 
 
 
747 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  28.1 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  32 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  32 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  32 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  31.9 
 
 
160 aa  47.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  32.04 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  32.08 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0483  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.62 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.506287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1594  N-6 Adenine-specific DNA methylase  30.28 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  30.61 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  25.23 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.58 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4243  hypothetical protein  28.47 
 
 
176 aa  40.8  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>