22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4328 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  337  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  47.06 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  44.33 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  41.23 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  41.23 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  46.94 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  37.84 
 
 		 246 aa  64.3  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.18 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  34.91 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  35.58 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  35.58 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  34.29 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  27.66 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  35.58 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  27.66 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  27.66 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  36 
 
 		 432 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  34 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 747 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  36.46 
 
 		 158 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.85 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>